魏晋时期，皇宫突发一起血案。宫女英慧(周放 饰)(周放 饰)在怙恃被杀后逃出皇宫。据传英慧带走了父亲珍藏的华佗《青囊经》最主要的部分章页，皇上(焦恩俊 饰)随即令太尉司马魁(陈继铭 饰)和大臣王赞捉拿英慧。　　华佗学生善珍因医术高明深得皇室宠幸，他开办的针灸治病的神针堂家喻户晓。其学生皇甫谧(陈浩民 饰)(陈浩民 饰)聪慧过人，但医术尚欠火候，善珍望其脚扎实地、受苦学艺。　　皇上(焦恩俊饰)要赐一宫女给善珍，他居心说喜欢女学生香苓(王鸥 饰)(王鸥 饰)，婉拒皇上盛意。但皇上依然派人来赐婚，此时香苓正要被华镇梁记大药房令郎梁柳(肖聪 饰)娶走，本就不肯意嫁给梁柳的香苓趁机上了善珍的花轿；矢椎妊丬咛Щ厣裾胩米急赣胧Ω低昊，但他在花轿内发明了受伤的宫女英慧，皇甫谧让好兄弟布准(樊少皇 饰)(樊少皇 饰)将英慧送到山寨；て鹄。　　善珍在与香苓的婚礼中突然晕倒，皇甫谧却坚决下针，却照旧没有挽回师傅的性命。此时宫中派人来请善珍给小皇子治病，善珍已故，二师兄难当大任，香苓坚决决议让皇甫谧前往；矢孜裙套⌒』首又卮蟮牟∏，获得了皇上的犒赏。但梁柳为了获得香苓，诬陷皇甫谧想娶师娘而居心侵占师傅，置其于死地。朝廷大臣王赞救下了皇甫谧，由于皇上的宠妃欲让皇甫谧为其治疗不孕之症。　　皇甫谧与香苓情绪深挚，梁柳对此铭心镂骨。梁柳在父亲被皇甫谧气死后，决议与皇甫谧拼个你死我活。梁柳的寄父司马魁在皇宫手握重权，他居心将皇甫谧和香苓的事说予皇上；噬霞较丬吆笮亩灰，香苓一再婉拒，皇上赐其贞节牌楼，这使得皇甫谧与香苓的前路雪上加霜；矢ι褚骄缯铡　∷韭砜右捎⒒塾肷裾胩糜泄叵，便要梁柳漆黑视察。差点受骗的英慧在布准等人的起劲下，最终看清了梁柳的真面目。　　皇上多次要求收获显著的皇甫谧进宫做官遭拒，司马魁趁机挑唆，诬陷皇甫谧藐视皇上。与此同时名士嵇康因拒写《帝王世纪》被赐死，皇甫谧只得委屈谴责赞成为皇上写史，但他更主要的使命是完成《针灸甲乙经》。瘟疫突如其来，皇甫谧请缨前往疫区;而司马魁与梁柳却贪赃枉法，并妄想害死皇甫谧。在布准、英慧等人的资助下，皇甫谧和香苓先后脱险，两人情绪日益深挚。　　司马魁寄希望于外甥女怀上龙种以抵达控制皇权的目的一直未能如愿，梁柳与丽妃(王泫伊 饰)偷情有身，司马魁担心被皇甫谧发明，一心想将其灭口。　　皇上将觊觎已久的香苓带入宫中强行封妃，香苓逃出宫后前往西域。因欺瞒皇上受到宫刑的梁柳不思悔改继续作恶，并向导兵勇将有着永生不老称呼的封衡抓捕；矢赘拔饔蚓确夂馐鼻捎霾甲己陀⒒，他们沿途又遇到了香苓所在的西域某国进献玉人的马队；矢子胂丬咚淙恢胤，但香苓和西域国曼丽公主一同进了宫，香苓跟皇上说若是把她充满后宫必会引起贫困。果真西域国向朝廷要地提倡进攻，司马魁带兵去还击却被毒箭射中。　　为害死皇甫谧，梁柳偷走其《帝王世纪》手稿，并将其扔进深山老林；矢妆幌丬哜锸阉，因祸得福赢得了撰写史书的时间。香苓的到来使皇甫谧对《青囊经》的完成更有信心。　　皇上以为皇甫谧再次逃跑，却在御书房发明了皇甫谧准期完成的手稿。感伤万千的皇上下令赠予皇甫谧一车书籍，并给予其自由；矢缀拖丬咧赵谇寰驳纳搅掷锝嵛。