由于赵猛的牵制，关威(曹云金 饰)向导新队员们乐成将美国牧师护送出成。不想赵猛却在退却途中众寡不敌，痛失一臂。

关威自得洋洋回到驻地，被武工队的老队员痛斥，在得知道赵猛断臂之事后刚刚得知道自己闯下了弥天大祸，愧疚不已。

两个月后，赵猛归队。苏先生(何政军 饰)祭日，关威在苏先生墓前真诚向赵猛致歉，二人摒弃前嫌，真正成为了生死与共的战友。

关威最先熟悉到了纪律和革命信仰对武工队的主要性，带动虚心接受赵猛的训练指导，整个武工队的军事素质和精神面目都面目一新。经由众人商议，众人决议拿日军征粮队练兵。此次战斗众人第一次配合无间，大获全胜。全灭征粮队标记着神勇武工队正式走向成熟，此时作为教官的史勇(范雷 饰)却决议知难而退。

与此同时，山田幸助又最先酝酿新一轮的阴谋，这次他的目的是关威的老家——史家镇。山田派兵放纵进驻史家镇，并以全镇人的性命要挟关威投降。原来日军已在史家镇重新建设神秘生化基地，现在万事具备，只差樱木一郎生前的试验资料。

山田知道关威有着过目成诵的影象力，这份资料一定还生涯在关威的脑海中。这种武器一但研发出来将会对战局爆发决议性的影响。

面临山田的威胁，众人最先苦苦思索破局之法。