1912年5月下旬，孙中山回抵家乡探望乡亲尊长，并到陆皓东坟前祭拜，孙中山回首往事，感伤万千；并向兄长孙眉谢罪。兄弟二人冰释前嫌、和洽如初。孙中山去澳门探望陈粹芬，陈粹芳已人去楼空，只留下一封信给孙中山。在回家的渡口，见到了陈粹芬收养的女儿。　　由于袁世凯只要从共和所获得的实权，而不要共和所主张的民主，孙中山很是生气，于1912年7月回到上海同盟会本部，因陈其美、蔡元培、宋教仁等纷纷从袁世凯内阁告退，内阁里已没有牵制袁世凯的实力了，孙中山决议去北京与袁世凯共商国策。　　1912年8月下旬孙中山与袁世凯在总统府会晤，共商国家大计。　　1913年2月，孙中山匹俦和宋嘉树匹俦启程前昔日本考察铁路。　　袁世凯把坚决维护暂时约法的宋教仁看故意腹大患，1913年3月20日，袁世凯派刺客谋害了宋教仁，果真破损暂时约法，阻挡共和，孙中山听到宋教仁被害的新闻，急遽赶回上海，召集黄兴等共商诛讨袁事宜；由于内部泛起阻挡意见，袁世凯得以可乘之机，国民党坐失良机，二次革命虽在天下发动，却仅仅坚持了四十八天，就以惨败了却。　　孙中山、黄兴等一批革命党人再次亡命外洋，回首灾祸深重的祖国，孙中山不得不最先了他越发深刻的人生思索。