1948年4月，共产党西北野战军提倡西府战争，围攻西北重镇宝鸡，国民党因此被迫放弃延安。

南京国防部二厅军事手艺随处长俞北平(陈建斌 饰)正在家中整理仪表，准备去赶去清城的火车见道济银行董事长张瀚民，去拿自己女儿徐丹妮(朱颜曼滋 饰)放在他处的五线谱谱纸。却不料张瀚民被南京国防部二厅特殊视察随处长郑翊(俞飞鸿 饰)查出是共产党潜在在南京的特务，郑翊当天便带人来到道济银行，见张瀚民不在，便挟持了道济银行的接待员，欲通过她逼问出关于共党的信息。

正在这时，俞北平恰恰打电话来道济银行找张瀚民，这让郑翊禁不住嫌疑俞北平是张瀚民的同党。

接待员在郑翊的监控下，战战兢兢地接完了俞北平的电话。随后，郑翊向她询问俞北平和张瀚民两人来往细节，接待员不欲见告其信息。郑翊见此掏脱手刀，残忍地刺穿了接待员的手心。接待员一时间痛不欲生，哀嚎连连。

与此同时，俞北平整理好了仪表要出门，正好遇到了楼下期待着他的岳父，南京国防部二厅副厅长徐文正(冯恩鹤 饰)。俞北平一直在徐文正的授意下，同张瀚民有生意来往，而此时张瀚民被查出是共产党，徐文正便提醒俞北平跟张瀚民实时撇开关系，省得淌入浑水。

而道济银行的接待员在郑翊的严刑逼供下，终于屈服，告诉他们共产党特务相约于今日下昼一点在九号公馆晤面。

俞北平在得知张瀚民被查出是共产党后，恐惧不已。他急遽来到与张瀚民事先约好的咖啡馆里和张瀚民晤面，并通知张瀚民他的共党身份已经袒露。原来，俞北平也是共党潜在在国民党的特务，而张瀚民正是他的联络员。张瀚民见告俞北平同上面新派下来的联络员晤面的时间所在，并告诉他要进一步追查代号为“比基尼”的《清城轴心中美联合攻防安排》，而与此事相关的部分资料正在九号公馆的包管柜里。在交接了一切事项后，为了掩护俞北平的身份，张瀚民自动伸手按下扳机，开枪自杀。

郑翊自从嫌疑俞北平后，就安排了人手监视俞北平。此时，她正在咖啡馆的车外实时监控着这两人的行为。郑翊一直智慧，她见俞北平开枪打死张瀚民后脱离咖啡馆，便推测俞北平是要去九号公馆，便提前驱车到那处期待他。效果不出她所料，俞北平果真去了那里。

俞北平究竟潜在在国民党国防部二十多年，心理素质过硬。在郑翊咄咄逼人的逼问下，他照旧坚持着镇静，告诉她他来此处是为取回同张瀚民生意的相关文件，来阻止被党纪处分。但张翊并欠好瞎搅，她为了进一步试探俞北平，提出让他资助开公馆里间包管柜的锁。

俞北平只能硬着头皮在郑翊欺压感甚重的视线中开了锁，但包管柜有共党同志们拼死换来的神秘文件，不可袒露于国民党前。俞北平在开锁后，寻机炸毁了包管柜。此举虽保住了新派下来的联络员的性命，但俞北平也因此找不到讨论员而断了同共党的联系，他的特务事情陷入死局。

与此同时，处于山东清城的特殊视察局派吴昆才(曹卫宇 饰)见告徐文正，清城的美军少校约翰于早上被不明人士枪杀，其所携绝密文件或已泄露，而该文件正好是共党所急需的《清城轴心中美联合攻防安排》。徐文正得知此事后，召开新闻宣布会，回应各界对美军少校约翰被枪杀一事的疑问，并透露国民党方嫌疑此举为共产党所为。

郑翊单独在屋中思索包管柜被炸毁一事，她嫌疑俞北平同此事脱不了关系，便让下属把俞北平的工具都送过来，她在检查物品的历程中发明了打火机。

徐文正找自己副官田皓商谈郑翊嫌疑俞北平的念头。俞北平是他的女婿，他万分不希望俞北平和共党有牵涉。之后，他让田皓通知郑翊自己会于六点半在聚会室听她汇报。

待郑翊到了聚会室后，徐文正诘责郑翊为何要抓俞北平，并以为她是因弟弟郑明在捷运行动中牺牲的缘故原由，而失去了冷静判断，提出要放假让她休息。郑翊则有条有理地告诉徐文正自己对俞北平的嫌疑。徐文正见她言之凿凿，不由被说动，便决议允许美方提出的要求，让俞北平去视察清城事务，以探俞北平的底。

之后，徐文正打电话给自己女儿，即俞北平的夫人徐咏仪(李煜 饰)，见告她明日清早他会派田皓接她去清城。与此同时，他也找了俞北平来自己办公室，诘责他之前一点都没注重到张的异常，俞北平的镇静批驳让徐文正的嫌疑有所作废。随后，徐文正交给俞北平关于案件的基本资料，以便他视察。